Molekylære forbindelser inneholder to eller flere ikke-metaller (ikke ammoniumionet). Vanligvis kan du gjenkjenne en molekylær forbindelse fordi det første elementet i forbindelsesnavnet er et ikke-metallisk. Noen molekylære forbindelser inneholder hydrogen, men hvis du ser en forbindelse som begynner med "H", kan du anta at det er en syre og ikke en molekylær forbindelse. Forbindelser som bare består av karbon med hydrogen kalles hydrokarboner. Hydrokarboner har sin egen spesielle nomenklatur, så de behandles annerledes enn andre molekylære forbindelser.
Ikke-metaller kan kombinere i en rekke forhold, så det er viktig at navnet på en molekylær forbindelse indikerer hvor mange atomer av hver type element som er til stede i forbindelsen. Dette oppnås ved å bruke prefikser. Hvis det bare er ett atom i det første elementet, brukes ingen prefiks. Det er vanlig å prefiksere navnet på ett atom i det andre elementet med mono-. For eksempel heter CO karbonmonoksid i stedet for karbonoksid.
Du kan skrive formelen for en kovalent forbindelse fra navnet ved å skrive symbolene for det første og andre element og oversette prefikset til underskripter. For eksempel vil xenonheksafluorid bli skrevet XF
6. Det er vanlig at studenter har problemer med å skrive formler fra forbindelsesnavn, da ioniske forbindelser og kovalente forbindelser ofte blir forvirrede. Du balanserer ikke avgifter for kovalente forbindelser; Hvis forbindelsen ikke inneholder et metall, ikke prøv å balansere dette!