Dette skjer ofte på grunn av geografisk isolasjon eller reproduktiv isolasjon av individer i befolkningen. Når artene utvikler seg og forgrener seg, kan de ikke lenger avle med medlemmer av den opprinnelige arten.
Fire typer naturlig spesiasjon kan forekomme basert på reproduktiv eller geografisk isolasjon, blant andre grunner og miljøfaktorer.
Prefikset allo- betyr "annet." Suffikset -patric, betyr "sted." Så allopatric er en type spesiasjon forårsaket av geografisk isolasjon. Individene som er isolert befinner seg bokstavelig talt på et "annet sted."
Den vanligste mekanismen for geografisk isolasjon er en faktisk fysisk barriere som kommer mellom medlemmer av en befolkning. Dette kan være noe så lite som et falt tre for små organismer eller så stort som å bli delt av hav.
Allopatrisk spesiasjon betyr ikke nødvendigvis at de to distinkte populasjonene ikke kan samhandle eller til og med avle med det første. Hvis barrieren som forårsaker den geografiske isolasjonen kan overvinnes, kan noen medlemmer av de forskjellige populasjonene reise frem og tilbake. Men et flertall av befolkningen vil holde seg isolert fra hverandre, og som et resultat vil de avvike fra forskjellige arter.
Prefikset peri- betyr "nær." Når du legger til suffikset -patric, oversettes det til "nær sted." Peripatric speciation er faktisk en spesiell type allopatric speciation. Det er fremdeles en slags geografisk isolasjon, men det er også en slags instans som får svært få individer til å overleve i den isolerte befolkningen sammenlignet med allopatrisk spesiasjon.
I peripatric spesiasjon kan det være et ekstremt tilfelle av geografisk isolasjon der bare noen få individer er isolert, eller det kunne følge ikke bare en geografisk isolasjon, men også en slags katastrofe som dreper alle unntatt noen få av de isolerte befolkning. Med et så lite genbasseng blir sjeldne gener ført oftere ned, noe som forårsaker Genetisk drift. De isolerte individene blir raskt uforenlige med sin tidligere art og blir en ny art.
Suffikset -patric betyr fortsatt "sted" og når prefikset para-, eller "ved siden av", er knyttet, innebærer det at befolkningen denne gangen ikke er isolert av en fysisk barriere og i stedet er "ved siden av" hverandre.
Selv om det ikke er noe som hindrer individene i hele befolkningen fra å blande seg og parre seg, skjer det fremdeles ikke i parapatrisk spesiasjon. Av en eller annen grunn parrer personer i befolkningen seg bare sammen med individer i sitt nærmeste område.
Noen faktorer som kan påvirke parapatrisk spesiasjon inkluderer forurensning eller manglende evne til å spre frø til planter. For at den skal klassifiseres som parapatrisk spesiasjon, må imidlertid befolkningen være kontinuerlig uten fysiske barrierer. Hvis det er fysiske barrierer til stede, må den klassifiseres som enten peripatrisk eller allopatrisk isolasjon.
Den endelige typen kalles sympatric speciation. Prefikset sym-, som betyr "det samme" med suffikset -patric, som betyr "sted" gir en pekepinn på betydningen av denne typen spesiasjon: Individene i befolkningen er ikke skilt i det hele tatt og alle bor på "samme sted." Så hvordan avviker befolkningen hvis de bor i det samme rom?
Den vanligste årsaken til sympatrisk spesiasjon er reproduktiv isolasjon. Reproduktiv isolasjon kan skyldes at individer kommer i paringssesongene sine til forskjellige tider eller foretrekker hvor de kan finne en kamerat. I mange arter kan valg av kamerater være basert på oppveksten. Mange arter vender tilbake til der de ble født for å pare seg. Derfor ville de bare være i stand til å parre seg med andre som er født på samme sted, uansett hvor de beveger seg og bor som voksne.
Andre årsaker kan være at forskjellige populasjoner blir avhengige av forskjellige behov i miljøet, for eksempel matkilder eller husly.