Aminosyrer er en type organisk syre som inneholder både en karboksylgruppe (COOH) og en aminogruppe (NH)2). Den generelle formelen for en aminosyre er gitt nedenfor. Selv om den nøytralt ladede strukturen ofte er skrevet, er den unøyaktig fordi den sure COOH og basiske NH2 grupper reagerer med hverandre for å danne et internt salt som kalles en zwitterion. Zwitterion har ingen netto kostnad; det er en negativ (COO-) og en positiv (NH3+) lade.
Det er 20 aminosyrer avledet fra proteiner. Mens det er flere metoder for å kategorisere dem, er en av de vanligste å gruppere dem etter arten av sidekjedene.
Det er åtte aminosyrer med ikke-polære sidekjeder. Glycin, alanin og prolin har små, ikke-polare sidekjeder og er alle svakt hydrofobe. Fenylalanin, valin, leucin, isoleucin og metionin har større sidekjeder og er sterkere hydrofobe.
Det er også åtte aminosyrer med polare, uladede sidekjeder. Serin og treonin har hydroksylgrupper. Asparagin og glutamin har amidgrupper. Histidin og tryptofan har heterocykliske aromatiske aminkantkjeder. Cystein har en sulfhydrylgruppe. Tyrosin har en fenolisk sidekjede. Sulfhydrylgruppen av cystein, fenolisk hydroksylgruppe av tyrosin og imidazolgruppe av histidin viser alle en viss grad av pH-avhengig ionisering.
Det er fire aminosyrer med ladede sidekjeder. Asparaginsyre og glutaminsyre har karboksylgrupper på sidekjedene. Hver syre er fullstendig ionisert ved pH 7,4. Arginin og lysin har sidekjeder med aminogrupper. Sidekjedene deres er fullstendig protonert ved pH 7,4.