Ikke alle bølgelengder av lys absorberes under fotosyntesen. Grønt, fargen på de fleste planter, er faktisk fargen som reflekteres. Lyset som tas opp deler vann i hydrogen og oksygen:
Mørke reaksjoner krever ikke lys, men de blir heller ikke hemmet av det. For de fleste planter finner de mørke reaksjonene sted på dagtid. Den mørke reaksjonen oppstår i stroma av kloroplasten. Denne reaksjonen kalles karbonfiksering eller Calvin syklus. I denne reaksjonen blir karbondioksyd omdannet til sukker ved bruk av ATP og NADPH. Karbondioksid er kombinert med et 5-karbon sukker for å danne et 6-karbon sukker. 6-karbon sukkeret blir brutt i to sukkermolekyler, glukose og fruktose, som kan brukes til å lage sukrose. Reaksjonen krever 72 fotoner lys.
Effektiviteten til fotosyntesen er begrenset av miljøfaktorer, inkludert lys, vann og karbondioksid. I varmt eller tørt vær kan planter stenge stomiene for å spare vann. Når stomaten er lukket, kan plantene starte fotorespirasjon. Planter kalt C4-planter opprettholder høye nivåer av karbondioksid i celler som lager glukose, for å unngå fotorespirasjon. C4-planter produserer karbohydrater mer effektivt enn normale C3-planter, forutsatt at karbondioksidet er begrensende og tilstrekkelig lys er tilgjengelig for å støtte reaksjonen. Ved moderate temperaturer blir det lagt for mye av en energibyrde på plantene til at C4-strategien er verdt (kalt 3 og 4 på grunn av antall karbonatomer i mellomreaksjonen). C4-planter trives i varme, tørre klima. Spørsmål
Her er noen spørsmål du kan stille deg, for å hjelpe deg med å finne ut om du virkelig forstår det grunnleggende om hvordan fotosyntesen fungerer.