Mongolia er høy, kald og tørr. Det har et ekstremt kontinentalt klima med lange, kalde vintre og korte somre, mens det faller mest nedbør. Landet gjennomsnitt 257 skyfri dager i året, og det er vanligvis i sentrum av en region med høyt atmosfærisk trykk. Nedbøren er høyest i nord, som gjennomsnitt 20 til 35 centimeter per år, og lavest i sør, som får 10 til 20 centimeter (se fig. 5). Det ekstreme sør er Gobi, hvor noen regioner ikke mottar noen nedbør i de fleste år. Navnet Gobi er en mongolsk som betyr ørken, depresjon, salt myr eller steppe, men som vanligvis refererer til en kategori av tørt rangeland med utilstrekkelig vegetasjon til å støtte marmoter, men med nok til å støtte kameler. mongolene skille gobi fra ørkenen, selv om skillet ikke alltid er tydelig for utenforstående som ikke er kjent med det mongolske landskapet. Gobi-områdene er skjøre og ødelegges lett ved overbeiting, noe som resulterer i utvidelse av den sanne ørkenen, et steinete avfall der ikke engang Bactriske kameler kan overleve.
Gjennomsnittstemperaturer over det meste av landet er under iskaldt fra november til mars og handler om frysing i april og oktober. Januar og februar er gjennomsnittet -20 ° C vanlig, med vinterkvelder på -40 ° C som forekommer de fleste år. Sommerekstremer når så høyt som 38 ° C i den sørlige Gobi-regionen og 33 ° C i Ulaanbaatar. Mer enn halve landet er dekket av permafrost, noe som gjør bygging, veibygging og gruvedrift vanskelig. Alle elver og ferskvannssjøer fryser om vinteren, og mindre bekker fryser ofte til bunnen. Ulaanbaatar ligger på 1 351 meter over havet i dalen Tuul Gol, en elv. Ligger i relativt godt vannet nord, får den et årlig gjennomsnitt på 31 centimeter utfelling, nesten alle som faller i juli og i august. Ulaanbaatar har en gjennomsnittlig årlig temperatur på -2,9 ° C og en frostfri periode som strekker seg i gjennomsnitt fra midten av juni til slutten av august.
Mongolias vær er preget av ekstrem variabilitet og kortsiktig uforutsigbarhet om sommeren, og de flerårige gjennomsnittene skjuler store variasjoner i nedbør, datoer for frost, og forekomster av snøstormer og vårstøv stormer. Slikt vær gir store utfordringer for overlevelse av mennesker og husdyr. Offisiell statistikk viser mindre enn 1 prosent av landet som dyrkbart, 8 til 10 prosent som skog, og resten som beite eller ørken. Korn, for det meste hvete, dyrkes i dalene i Selenge-elvesystemet i nord, men gir avkastning svinger vidt og uforutsigbart som et resultat av mengden og tidspunktet for regn og datoene for drepe frost. Selv om vintrene generelt er kalde og klare, er det noen ganger snøstormer som ikke legger mye snø, men dekker gressene med nok snø og is til å gjøre beite umulig, og drepe titusenvis av sauer eller storfe. Slike tap av husdyr, som er en uunngåelig og på en måte en normal konsekvens av klimaet, har gjort det vanskelig å oppnå planlagte økninger i antall husdyr.