Kapillærer er så små at røde blodceller kan bare reise gjennom dem i én fil. Kapillærene måler i størrelse fra omtrent 5 til 10 mikrometer i diameter. Kapillærvegger er tynne og er sammensatt av endotelet (en type enkel squamous epitelvev). Oksygen, karbondioksid, næringsstoffer og avfall byttes gjennom de tynne veggene i kapillærene.
Kapillærer spiller en viktig rolle i mikrosirkulasjonen. Mikrosirkulasjon omhandler sirkulasjon av blod fra hjerte til arterier, til mindre arterioler, til kapillærer, til venules, til vener og tilbake til hjertet.
Strømmen av blod i kapillærene styres av strukturer som kalles prekapillære sfinkterer. Disse strukturene er plassert mellom arterioler og kapillærer og inneholder muskelfibre som lar dem trekke seg sammen. Når lukkemuskler er åpne, strømmer blod fritt til kapillærbedene i kroppsvevet. Når lukkemuskulaturen er lukket, får ikke blod strømme gjennom kapillærbedene. Væskeutveksling mellom kapillærene og kroppens vev finner sted ved kapillærbedet.
Kapillærer er der det utveksles væsker, gasser, næringsstoffer og avfall mellom blod og kropp
vev av diffusjon. Kapillærvegger inneholder små porer som lar visse stoffer passere inn og ut av blodkaret. Væskeutveksling styres av blodtrykk i kapillærbeholderen (hydrostatisk trykk) og osmotisk trykk av blodet inne i karet. Det osmotiske trykket produseres ved høye konsentrasjoner av salter og plasma proteiner i blodet. Kapillærveggene tillater vann og små oppløste stoffer å passere mellom porene, men lar ikke proteiner passere.