Det tok bare tretten dager for Ilkhanate-mongolene og deres allierte å få islamens gullalder til å krasje. Øyevitner rapporterte at den mektige Tigris-elven løp svart av blekk fra dyrebare bøker og dokumenter ødelagt sammen med Grand Library of Bagdad, eller Bayt al-Hikmah. Ingen vet med sikkerhet hvor mange borgere i landet Abbasid Empire døde; estimater varierer fra 90 000 til 200 000 opp til 1 000 000. I løpet av to korte uker ble setet for læring og kultur for hele den muslimske verden erobret og ødelagt.
Bagdad hadde vært en søvnig fiskevær på Tigris før den ble forfremmet til status som hovedstaden av den store abbasidiske kalifen al-Mansur i 762. Hans barnebarn, Harun al-Rashid, subsidierte forskere, religiøse lærde, diktere og kunstnere, som strømmet til byen og gjorde den til en akademisk juvel fra middelalderens verden. De lærde og forfattere produserte utallige manuskripter og bøker mellom slutten av 800-tallet og 1258. Disse bøkene ble skrevet på en ny teknologi importert fra Kina etter
Battle of Talas River, en teknologi som heter papir. Snart var de fleste av befolkningen i Bagdad litterært og godt lest.Mongoler forenes
Langt øst for Bagdad klarte i mellomtiden en ung kriger kalt Temujin å forene mongolene og tok tittelen Genghis khan. Det ville være hans barnebarn, Hulagu, som ville skyve grensene for det mongolske riket inn i det som nå er Irak og Syria. Hulagus hovedformål var å styrke hans grep om hjertet av Ilkhanatet i Persia. Han utslettet først den fanatiske sjiamuslimske gruppen, kjent som the Assassinsog ødela fjellstedsborgen deres i Persia, og marsjerte deretter sørover for å kreve at abbasidene skulle kapitulere.
Kalifen Mustasim hørte rykter om mongolenes fremgang, men var sikker på at hele den muslimske verden ville reise seg for å forsvare sin hersker om nødvendig. Imidlertid hadde den sunnimuslimske kalifen nylig fornærmet sine sjiamuslimske undersåtter, og hans egen sjiamuslimske store vizier, al-Alkamzi, kan til og med ha invitert mongolene til å angripe det dårlig ledede kalifatet.
Sent i 1257 sendte Hulagu en melding til Mustasim med krav om at han skulle åpne portene til Bagdad for mongolene og deres kristne allierte fra Georgia. Mustasim svarte at den mongolske lederen burde returnere dit han kom fra. Hulagus mektige hær marsjerte videre, omringet Abbasid hovedstad, og slaktet kalifens hær som sallert ut for å møte dem.
Mongolene angriper
Bagdad holdt ut i tolv dager til, men den tålte ikke mongolene. Da byens murer falt, stormet hordene inn og samlet fjell av sølv, gull og juveler. Hundretusenvis av Bagdadere døde, slaktet av Hulagus tropper eller deres georgiske allierte. Bøker fra Bayt al-Hikmah, eller House of Wisdom, ble kastet i Tigris, angivelig, så mange at en hest kunne ha gått over elven på dem.
Kalifens vakre palass av eksotiske skoger ble brent til grunn, og kalifen selv ble henrettet. Mongolene mente at søl av kongelig blod kan forårsake naturkatastrofer som jordskjelv. Bare for å være sikker, pakket de Mustasim inn i et teppe og red hestene over ham og trampet ham i hjel.
Fallet i Bagdad signaliserte slutten på Abbasid-kalifatet. Det var også høydepunktet av mongolsk erobring i Midtøsten. Distrahert av sin egen dynastiske politikk, gjorde mongolene et halvhjertet forsøk på å erobre Egypt, men ble beseiret ved Slaget ved Ayn Jalut i 1280. Det mongolske riket skulle ikke vokse lenger i Midt-Østen.