Opprinnelig klassifisert som en proterosuchid (og dermed en nær slektning av den moderne Proterosuchus), har en fersk analyse lokalisert Xilousuchus mye nærmere til roten av arkosaur-slektstreet (arkosaurene var familien til tidlige trias-reptiler som ga opphav til dinosaurer, pterosaurer og krokodiller). Betydningen av Xilousuchus er at den stammer helt fra begynnelsen av triasperioden, omtrent 250 millioner år siden, og det ser ut til å ha vært en av de tidligste krokodiljearkosaurene, et hint om at disse "herskende øgler" delte seg ut inn i forhistoriske krokodiller og forfedrene til første dinosaurer (og dermed av de første fuglene) mye tidligere enn man tidligere hadde trodd. For øvrig var den asiatiske Xilousuchus nær slektning med en annen seilt arkosaur i Nord-Amerika, Arizonasaurus.
Hvorfor hadde kattestørrelsen Xilousuchus seil på ryggen? Den mest sannsynlige forklaringen er seksuell seleksjon; kanskje Xilousuchus-hanner med større seil var mer attraktive for kvinner i parringssesongen, eller kanskje seilet lurte rovdyrene til å tro at Xilousuchus var større enn det var, og sparte det fra å være det spist. Gitt den lille størrelsen, er det imidlertid veldig usannsynlig at seilet til Xilousuchus serverte noen temperert reguleringsfunksjon; det er en mer sannsynlig hypotese for 500 pund reptiler som
Dimetrodon, som trengte å varme raskt opp i løpet av dagen og spre overflødig varme om natten. Uansett, mangelen på seilte krokodiller i den senere fossile posten antyder at denne strukturen ikke var avgjørende for å overleve denne utbredte familien.