Hva er Three Domain System?

The Three Domain System, utviklet av Carl Woese i 1990, er et system for klassifisering av biologiske organismer.

Før Woeses oppdagelse av archaea forskjellig fra bakterier i 1977, mente forskere at det bare var to typer liv: eukarya og bakterier.

Den høyeste rangeringen som tidligere ble brukt hadde vært "rike", basert på Five Kingdom-systemet som ble vedtatt på slutten av 1960-tallet. Denne klassifiseringssystemmodellen er basert på prinsipper utviklet av svensk forsker Carolus Linné, hvis hierarkiske system grupperer organismer basert på felles fysiske egenskaper.

Når forskere lærer mer om organismer, endres klassifiseringssystemer. Genetisk sekvensering har gitt forskere en helt ny måte å analysere sammenhenger mellom organismer.

Det nåværende Three Domain System grupperer organismer primært basert på forskjeller i ribosomal RNA (rRNA) struktur. Ribosomal RNA er en molekylær byggestein for ribosomer.

Under dette systemet er organismer klassifisert i tre domener og seks riker. Domenene er

• archaea
• Bakterie
• eukarya

Kongedømmene er

• Archaebacteria (eldgamle bakterier)
• Eubakterier (ekte bakterier)
• Protistriket
• sopp
• Plantae
• Animalia

Dette Archaea-domenet inneholder encellede organismer. archaea ha gener som ligner begge deler bakterie og eukaryoter. Fordi de er veldig lik bakterier i utseende, ble de opprinnelig forvekslet med bakterier.

Som bakterier, er archaea prokaryote organismer og har ikke membranbundet cellekjernen. De mangler også intern celle organeller og mange har omtrent samme størrelse som og ligner form som bakterier. Archaea reproduserer ved binær fisjon, har ett sirkulært kromosom, og bruk flag å bevege seg rundt i omgivelsene sine, som bakterier.

Archaea skiller seg fra bakterier i celleveggen sammensetning og skiller seg fra både bakterier og eukaryoter i membran sammensetning og rRNA-type. Disse forskjellene er betydelige nok til å garantere at archaea har et eget domene.

Archaea er ekstreme organismer som lever under noen av de mest ekstreme miljøforholdene. Dette inkluderer hydrotermiske ventilasjonsåpninger, sure kilder og under arktisk is. Archaea er delt inn i tre hovedfilaser: Crenarchaeota, Euryarchaeota, og Korarchaeota.

• Crenarchaeota inkluderer mange organismer som er hypertermofile og termoacidofile. Disse archaea trives i miljøer med ekstreme temperaturer (hypertermofiler) og i ekstremt varme og sure miljøer (termoacidophiles.)
• Archaea kjent som metanogener er av Euryarchaeota phylum. De produserer metan som et biprodukt av metabolisme og krever et oksygenfritt miljø.
• Lite er kjent om Korarchaeota archaea som det er funnet få arter som lever på steder som varme kilder, hydrotermiske ventilasjonsåpninger og obsidian bassenger.

Bakterier er klassifisert under bakteriedomenet. Disse organismer er generelt fryktet fordi noen er det patogene og i stand til å forårsake sykdom.

Imidlertid er bakterier essensielle for livet, da noen er en del av menneskelig mikrobiota. Disse bakteriene forformer viktige funksjoner, for eksempel slik at vi kan fordøye og absorbere næringsstoffer fra maten vi spiser. Bakterier som lever på huden forhindrer patogene mikrober i å kolonisere området og hjelper også til aktivering av immunforsvar.

Bakterier er også viktige for resirkulering av næringsstoffer i det globale økosystemet ettersom de er primære dekomponere.

Bakterie har en unik celleveggsammensetning og rRNA-type. De er gruppert i fem hovedkategorier:

• Proteobacteria: Denne filylen inneholder den største gruppen av bakterier og inkluderer E. coli, Salmonella, Heliobacter pylori, og Vibrio. bakterie.
• cyanobakterier: Disse bakteriene er i stand til fotosyntese. De er også kjent som blågrønne alger på grunn av fargen.
• firmicutes: Disse gram-positive bakteriene inkluderer Clostridium, Bacillus, og mycoplasmas (bakterier uten cellevegger.)
• Chlamydia: Disse parasittiske bakterier reproduserer inne i vertens celler. Organismer inkluderer Klamydia trachomatis (forårsaker klamydia STD) og Chlamydophila pneumoniae (fører til lungebetennelse.)
• spirochetes: Disse korketrekkerformede bakteriene utviser en unik vridningsbevegelse. Eksempler inkluderer Borrelia burgdorferi (forårsaker Lyme sykdom) og Treponema pallidum (forårsaker syfilis.)

Eukarya-domenet inkluderer eukaryoter eller organismer som har en membranbundet kjerne.

Dette domenet er videre delt inn i kongedømmene

• Protistriket
• sopp
• Plantae
• Animalia

Eukaryoter har rRNA som er forskjellig fra bakterier og arkaeaner. Anlegg og fungi organismer inneholder cellevegger som er forskjellige i sammensetning enn bakterier. Eukaryote celler er typisk resistente mot antibakterielle antibiotika.

Organismer i dette domenet inkluderer protister, sopp, planter og dyr. Eksempler inkluderer alger, amøbe, sopp, mugg, gjær, bregner, moser, blomsterplanter, svamper, insekter og pattedyr.

Systemer for å klassifisere organismer endres med nye funn gjort over tid. De tidligste systemene anerkjente bare to riker (plante og dyr.) Det nåværende Three Domain System er det beste organisasjonssystem vi har nå, men etter hvert som ny informasjon er innhentet, kan et annet system for klassifisering av organismer senere utvikles.

Slik sammenlignes Five Kingdom System med Three Domain System, som har seks riker:

Five Kingdom System:

• Monera
• Protistriket
• sopp
• Plantae
• Animalia